东条英机在确知是逮捕他的时候，就关好门窗拿起手枪，透过衬衫向画圈的地方开了枪。他是左撇子，开枪时偏高了点，所以子弹偏离了心脏，演出了一幕畏罪自杀未遂的丑剧。
东条英机原想自杀以逃避世界人民对他的审判，但经过及时抢救很快恢复了健康。美国占领军把东条英机送到第11监狱。不久，远东国际军事法庭把东条英机转移到巢鸭监狱。这所监狱地处东京西北，过去由于野鸭在这里筑巢，故取名巢鸭。东条英机到巢鸭监狱后，办理了入狱手续，进行了身体检查和消灭虱子。两三天后，监狱的司令官让东条英机暂住在44号单身牢房。“四”和“死”在日语的发音里是相同的，在东条英机看来，这是一个不吉利的数字，尤其又是“四十四”那就更不吉利了。
狱中的战犯们，过去在开内阁会议或御前会议时都是同席的熟人。但是在巢鸭狱中，不论是领取饭菜还是在广场上散步，他们都有意避开东条英机。东条英机也经常把饭菜拿回单身牢房里吃。