进入新世纪以后，县改区一度停滞。如2005年至2009年，只有8个“县(市)改区”。情况发生逆转是在2009年7月，财政部公布《关于推进省直接管理县财政改革的意见》中提出，到2012年年底前，力争全国除民族自治地区外全面推进省直接管理县财政改革。
有专家分析，“省直管县财政”不再经过地级市，地级市难以再“雁过拔毛”，地级市政府财力大大削弱。一些地级市政府为避免所辖县(市)脱离自己管辖，因而加快了县(市)改区步伐。从2010年年底至今，已经有19个“县(市)改区”，其中，“县改区”有14个。
分析认为，省直管县财政，是为今后实施行政上的“省直管县”作准备。县(市)改区与中央要推行的省直管县会产生冲突，都涉及管理权转移问题。
地级市加快了撤县(市)改区，不排除一些地级市担心所辖的县(市)脱离管辖。自2009年省直管县财政推开以后，一些地级市为避免所辖的县和县级市今后可能脱离其管辖，大力推行“县(市)改区”，进行权力“上收”。
有些地方政府热衷于县改区，主要是因为县和县级市有完整而独立的行政管理职能，如财政、人事、规划等独立的决策权限。而行政级别与县(县级市)相同的市辖区的行政管理职能不完整，只能依附于地级市，其财政、人事、规划等都由地级市来决策。如，县(市)有实行独立决策的局，而区则只有分局等派出机构。